产品介绍
全球水产品业有效实验院珠江水产品业实验所惠阳淡水虾隔代染色体繁育特色化组于凌云教授实验专业团队与深圳康普森农业能力发展科技发展限制单位合伙,回收根据康普森CAGT®靶向疗法疗法采集测序能力,研发培训了兼备自主性知识点使用权的罗氏沼虾200K靶向疗法疗法采集繁育集成电路芯片“臻珠2号”。“臻珠2号”兼备染色体染色体组涵盖全部、料工费低、功用好、合理率高等教育的特点,可应用于罗氏沼虾隔代染色体丰富多彩性测试、种质产品评定、功用染色体染色体收集和染色体染色体组的选择繁育等实验,有罗氏沼虾隔代染色体种质产品的联合开发与回收根据提供数据近期的原子平台。回收根据“臻珠2号”可育出罗氏沼虾的新品发布发布种,进1步有效降低研发料工费,为育出繁殖快、抗病力(逆)强、品控优秀的罗氏沼虾新品发布发布种打下知识基础。
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基带芯片数据信息
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关键的性能指标
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臻珠6号
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标注信息内容
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标记图片类行
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SNP
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标志比例
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200000
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效果位点
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22
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测序品系
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不同的省份从何而来的237只罗氏沼虾
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表1 “臻珠1号”育种芯片位点组成及分布数量
数据表现
研究团队先后在越南、缅甸、斯里兰卡、浙江、江苏、广西和广东等8个区域收集罗氏沼虾237只。为获得充足可供挖掘的基因组遗传变异位点,对这些样本开展了高深度重测序工作,最终获得24,421,454个SNP位点。在这些数据的基础上,结合研究团队前期研究得到的22个个体鉴定位点,最终筛选出200,000个罗氏沼虾核心SNP位点,这些位点均匀地分布在59条染色体上(图1),并表现出较高的遗传多样性(图2)。使用重测序得到的位点和臻珠1号的200K位点对部分样品分别进行聚类分析,结果显示样本聚集情况在二者中表现基本一致(图3),说明该芯片可较好地代表群体原始状况。
图1 臻珠1号SNP位点在染色体上的位置分布
图2 臻珠1号SNP位点的MAF分布
图3 不同位点集的进化树结果(上图200K,下图所有位点)